虽然大多数中、小企业在部署Web 应用时都采用直在一服务器模式，也就是把所有与Web应用相关的服务器系统都集成在一台服务器中， 这样做最大的好处当然就是成本低了，但对于大多数大、中型企业来说，这种应用模式是非常不可取的：一方面会使整个企业Web 应用的效率降低，另一方面还将带来巨大的安全隐患。
因为如果把Web应用所铺的数据库系统也放在Web服务器上的话，因Web应用需要在防火地上开启相应的端口，这样企业电子商务的数据库系统就会暴露在外部网络中，非常不安全。
目前主流的应用模式是采用两台或多台服务器，一台为前端的Web服务器，另一台作为后台的数据库服务器。Web 服务器可置于防火墙的DMZ区，而后台的数据库服务器则可置于在防火堵保护之下的内部网络。前端Web服务器承载实现Web应用的软件及中间件，数据库服务练主要承载后端的数据库应用，实现访问时的数据库调用。
Web服务器与其他服务器的主要区别不是体现在上述硬件方面，更重要的是它的软件系统，它需要一整套的Web服务器软件来组建Web站点、支持Web应用。比较大的品牌Web服务器都同时提供了自己的Web服务器软件系统，功能一般都非常强大，而不是像一般的服务器那样只提供带有操作系统的主机。
目前Web服务器软件系统有多种选择，不同方案所适应的服务器环境(包括服务器处理器架构和网络操作系统两个主要方面)并不完全一样。当然，现在主流的Web服务器方案均能适应绝大多数服务器环境，只是有个最佳搭配而已。
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